Theo quy hoạch, phạm vi ranh giới lập quy hoạch là dải không gian ven biển phía Nam tỉnh Khánh Hòa, bao gồm một phần các xã: Công Hải, Vĩnh Hải, Ninh Hải, Xuân Hải, Phước Dinh, Cà Ná và các phường Đông Hải, Ninh Chữ. Tổng diện tích quy hoạch khoảng 10.200ha đất liền và khoảng 2.000ha mặt biển, phục vụ phát triển các hoạt động du lịch, dịch vụ và nghỉ dưỡng.

Mục tiêu của quy hoạch nhằm xây dựng Khu du lịch quốc gia Ninh Chữ trở thành một trong những khu du lịch trọng điểm của cả nước, có hệ thống hạ tầng kỹ thuật và hạ tầng xã hội đồng bộ; sản phẩm du lịch đa dạng, chất lượng cao, có khả năng cạnh tranh trong khu vực và quốc tế. Đồng thời khu du lịch này còn góp phần thúc đẩy phát triển kinh tế - xã hội khu vực ven biển phía nam tỉnh Khánh Hòa, gắn với bảo tồn các giá trị cảnh quan, sinh thái và văn hóa đặc trưng.
Theo dự báo, đến năm 2030, Khu du lịch quốc gia Ninh Chữ có thể đón khoảng 5,9 triệu lượt khách, trong đó có khoảng 743.000 lượt khách quốc tế. Đến năm 2045 đón khoảng 9,84 triệu lượt khách với hơn 1,5 triệu lượt quốc tế. Quy mô cơ sở lưu trú dự kiến đạt 70.000 – 75.000 phòng vào năm 2045.

Quy hoạch định hướng phát triển theo mô hình tuyến đa trung tâm, gồm 3 phân vùng lớn với 8 phân khu chức năng.
Vùng phía Bắc gồm ba phân khu: Bình Tiên - Bãi Thùng; Vĩnh Hy - Núi Chúa; Nam Núi Chúa - Hang Rái - Công viên đá. Tập trung phát triển du lịch sinh thái cao cấp gắn với bảo tồn hệ sinh thái tự nhiên, khai thác giá trị "biển - rừng - nông nghiệp".
Vùng trung tâm bao gồm hai phân khu: Thanh Hải - lướt ván diều; Đầm Nại - Ninh Chữ - Đông Hải. Đây là vùng phát triển dịch vụ du lịch và đô thị du lịch biển với các sản phẩm "di sản - nghỉ dưỡng - ẩm thực".
Bãi biển Bình Sơn – Ninh Chữ giữ vai trò trung tâm trọng điểm, là bộ mặt của toàn khu, nơi hình thành quảng trường biển, công viên ven biển, các tổ hợp lưu trú quy mô lớn.
Vùng phía Nam gồm sông Dinh - Sơn Hải; Mũi Dinh và đường ven biển Mũi Dinh - Cà Ná. Vùng này định hướng phát triển gắn với năng lượng tái tạo, kết hợp các loại hình thể thao mới, du lịch mạo hiểm, nghỉ dưỡng và khám phá với chủ đề "cát - muối - biển".
UBND tỉnh Khánh Hòa có trách nhiệm tổ chức công bố công khai đồ án quy hoạch, xây dựng kế hoạch triển khai và quản lý phát triển khu du lịch theo đúng quy định.
Ninh Chữ là một trong những bãi biển đẹp của miền Trung, với đường bờ biển hình vòng cung dài khoảng 10km, cát trắng mịn và nước biển trong xanh. Khí hậu khu vực khô ráo, nhiều nắng, ít chịu ảnh hưởng của bão, thuận lợi cho việc tổ chức các hoạt động du lịch biển quanh năm.
Ngoài lợi thế về cảnh quan thiên nhiên, khu vực Ninh Chữ còn nằm gần nhiều điểm tham quan nổi tiếng như vịnh Vĩnh Hy, Vườn quốc gia Núi Chúa và các làng nghề truyền thống ven biển. Những yếu tố này tạo điều kiện để phát triển các sản phẩm du lịch kết hợp giữa nghỉ dưỡng, khám phá thiên nhiên và trải nghiệm văn hóa bản địa.